Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRAMD4Q6IC98 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD4Q6IC98 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms