Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ANKRD40Q6AI12 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.7 ms