Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms