Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF123Q5XPI4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms