Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RRAGBQ5VZM2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms