Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT97

SYDE2, Rho GTPase-activating protein SYDE2, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE2Q5VT97 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYDE2Q5VT97 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SYDE2Q5VT97 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms