Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C12orf60Q5U649 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.2 ms