Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms