Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms