Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PERM1Q5SV97 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PERM1Q5SV97 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms