Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms