Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQI0

ATAT1, Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAT1Q5SQI0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATAT1Q5SQI0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms