Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNT1Q5JUK3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNT1Q5JUK3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms