Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms