Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms