Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC39A12Q504Y0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms