Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTXN3Q4LDR2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms