Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY89

ELOA3B, Elongin-A3 member B, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOA3BQ3SY89 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELOA3BQ3SY89 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELOA3BQ3SY89 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ELOA3BQ3SY89 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELOA3BQ3SY89 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELOA3BQ3SY89 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ELOA3BQ3SY89 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELOA3BQ3SY89 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELOA3BQ3SY89 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELOA3BQ3SY89 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELOA3BQ3SY89 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELOA3BQ3SY89 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELOA3BQ3SY89 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELOA3BQ3SY89 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELOA3BQ3SY89 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELOA3BQ3SY89 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELOA3BQ3SY89 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELOA3BQ3SY89 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELOA3BQ3SY89 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELOA3BQ3SY89 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELOA3BQ3SY89 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELOA3BQ3SY89 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ELOA3BQ3SY89 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELOA3BQ3SY89 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELOA3BQ3SY89 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELOA3BQ3SY89 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELOA3BQ3SY89 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELOA3BQ3SY89 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELOA3BQ3SY89 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELOA3BQ3SY89 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms