Protein–RNA interactions for Protein: Q38SD2

LRRK1, Leucine-rich repeat serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRK1Q38SD2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRK1Q38SD2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRK1Q38SD2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms