Protein–RNA interactions for Protein: Q2VIQ3

KIF4B, Chromosome-associated kinesin KIF4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4BQ2VIQ3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KIF4BQ2VIQ3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KIF4BQ2VIQ3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KIF4BQ2VIQ3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KIF4BQ2VIQ3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KIF4BQ2VIQ3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KIF4BQ2VIQ3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KIF4BQ2VIQ3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KIF4BQ2VIQ3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KIF4BQ2VIQ3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KIF4BQ2VIQ3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KIF4BQ2VIQ3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KIF4BQ2VIQ3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KIF4BQ2VIQ3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KIF4BQ2VIQ3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KIF4BQ2VIQ3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KIF4BQ2VIQ3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KIF4BQ2VIQ3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KIF4BQ2VIQ3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KIF4BQ2VIQ3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KIF4BQ2VIQ3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KIF4BQ2VIQ3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KIF4BQ2VIQ3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KIF4BQ2VIQ3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KIF4BQ2VIQ3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KIF4BQ2VIQ3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KIF4BQ2VIQ3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KIF4BQ2VIQ3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KIF4BQ2VIQ3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KIF4BQ2VIQ3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KIF4BQ2VIQ3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms