Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RFX7Q2KHR2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms