Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ECM1Q16610 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
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