Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF239Q16600 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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