Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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