Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDB1Q16531 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDB1Q16531 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDB1Q16531 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDB1Q16531 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDB1Q16531 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDB1Q16531 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDB1Q16531 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDB1Q16531 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDB1Q16531 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDB1Q16531 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDB1Q16531 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDB1Q16531 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDB1Q16531 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDB1Q16531 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDB1Q16531 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDB1Q16531 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms