Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A5Q15758 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms