Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 MPHOSPH10-202ENST00000468427 483 ntTSL 413.29□□□□□ -0.286e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 C18orf25-205ENST00000619230 3744 ntTSL 213.28□□□□□ -0.286e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 MAD1L1-209ENST00000438959 839 ntTSL 313.27□□□□□ -0.296e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 FBF1-210ENST00000592193 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.36e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.36e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.36e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 OSBPL7-208ENST00000583167 4497 ntTSL 213.12□□□□□ -0.311e-6■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 DCTD-207ENST00000507543 1874 ntTSL 513.12□□□□□ -0.316e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 RAP1GAP2-201ENST00000254695 6661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.316e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.316e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TCF3-205ENST00000585731 1222 ntTSL 213.06□□□□□ -0.326e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 AKT1-213ENST00000555458 705 ntTSL 212.98□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SPOUT1-204ENST00000467582 898 ntTSL 212.95□□□□□ -0.346e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ST3GAL3-202ENST00000330208 1479 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.346e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 GPD1-201ENST00000301149 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.346e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 PNPLA7-201ENST00000277531 4581 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.356e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 KRBA1-201ENST00000319551 4020 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.356e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 PLEKHA7-218ENST00000636113 2981 ntTSL 512.87□□□□□ -0.356e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 PGD-209ENST00000496718 506 ntTSL 212.83□□□□□ -0.366e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 MAP3K3-206ENST00000577839 594 ntTSL 312.83□□□□□ -0.366e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SPATA20-222ENST00000512416 845 ntTSL 312.82□□□□□ -0.366e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 PRKD2-217ENST00000602155 1043 ntTSL 212.81□□□□□ -0.366e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SLC25A22-218ENST00000531514 641 ntTSL 412.81□□□□□ -0.366e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 NAA40-207ENST00000542633 559 ntTSL 512.79□□□□□ -0.367e-13■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 KRBA1-209ENST00000621069 3449 ntTSL 1 (best)12.76□□□□□ -0.376e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 MRPS12-204ENST00000598734 641 ntTSL 312.73□□□□□ -0.376e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ANKRD52-203ENST00000548241 651 ntTSL 312.71□□□□□ -0.376e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ZBTB17-205ENST00000462525 776 ntTSL 212.7□□□□□ -0.382e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 FBF1-201ENST00000319129 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.7□□□□□ -0.386e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TYRO3-202ENST00000559066 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.382e-6■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 CORO1C-201ENST00000261401 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.392e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ABCB8-222ENST00000542328 4371 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.396e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 GPD1-202ENST00000547190 740 ntTSL 512.53□□□□□ -0.46e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 GTF2A2-206ENST00000472508 202 ntTSL 312.49□□□□□ -0.416e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 BAHCC1-206ENST00000584436 10801 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.416e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 KRBA1-203ENST00000485033 3434 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.416e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 NR1I2-201ENST00000337940 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.426e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 FBF1-212ENST00000636174 3626 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.426e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 NR1I2-207ENST00000640105 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.426e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 AKR7A2-203ENST00000481966 488 ntTSL 312.43□□□□□ -0.426e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 WBP11-201ENST00000261167 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.426e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 RAP1GAP2-204ENST00000542807 3110 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.426e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 NR1I2-202ENST00000393716 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.426e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 MAP3K3-208ENST00000579585 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.436e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SLC23A1-207ENST00000508270 509 ntTSL 312.34□□□□□ -0.436e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 RAP1GAP2-203ENST00000540393 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.446e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SUGP1-212ENST00000591007 1377 ntTSL 1 (best)12.28□□□□□ -0.446e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 GIT1-204ENST00000473217 3462 ntTSL 1 (best)12.27□□□□□ -0.446e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SUGP2-210ENST00000598202 764 ntTSL 412.23□□□□□ -0.456e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 MAP3K3-205ENST00000577784 565 ntTSL 412.23□□□□□ -0.456e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 DPP9-215ENST00000599163 835 ntTSL 512.21□□□□□ -0.452e-8■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 BRPF1-208ENST00000497565 689 ntTSL 312.2□□□□□ -0.466e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 CNN2-207ENST00000565096 2109 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.466e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 GTF2A2-209ENST00000559141 293 ntTSL 512.15□□□□□ -0.466e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 CENPC-205ENST00000510189 2917 ntTSL 1 (best)12.14□□□□□ -0.476e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 MICAL3-203ENST00000400561 3046 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.476e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 RAP1GAP2-202ENST00000366401 6616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.476e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ATP1A1-211ENST00000537345 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.476e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SKP2-202ENST00000274255 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.482e-8■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 GTF2A2-202ENST00000396060 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.486e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 WRNIP1-201ENST00000380764 1557 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.486e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 MICAL3-210ENST00000495076 5113 ntTSL 512□□□□□ -0.496e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 C18orf25-202ENST00000588730 586 ntTSL 511.99□□□□□ -0.496e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 PDCD11-201ENST00000369797 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.56e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 KRBA1-207ENST00000496259 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.516e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.526e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TRMT1-215ENST00000591425 454 ntTSL 411.75□□□□□ -0.531e-8■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 CSPG4P10-202ENST00000612093 3411 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.536e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 RAP1GAP2-208ENST00000575979 543 ntTSL 411.71□□□□□ -0.536e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 RPS21-203ENST00000370592 401 ntTSL 211.66□□□□□ -0.549e-19■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ABCB8-219ENST00000491920 717 ntTSL 211.64□□□□□ -0.556e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 STK33-202ENST00000358872 1991 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.556e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SEC23IP-205ENST00000470478 285 ntTSL 211.54□□□□□ -0.566e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 RPE-202ENST00000359429 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.576e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ACACB-212ENST00000543080 583 ntTSL 311.5□□□□□ -0.576e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 GIT1-214ENST00000585148 686 ntTSL 311.49□□□□□ -0.576e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TMEM183A-203ENST00000468449 763 ntTSL 311.48□□□□□ -0.572e-13■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 PIGG-220ENST00000511448 903 ntTSL 511.46□□□□□ -0.576e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 MYLK-205ENST00000360772 10027 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.586e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 COL2A1-208ENST00000493991 3756 ntTSL 211.46□□□□□ -0.586e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 NAA40-209ENST00000544194 929 ntTSL 211.44□□□□□ -0.587e-13■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 FBXO18-210ENST00000475867 912 ntTSL 211.42□□□□□ -0.586e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ZMYM1-206ENST00000466390 508 ntTSL 311.35□□□□□ -0.596e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SEMA7A-205ENST00000569617 473 ntTSL 311.32□□□□□ -0.66e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TRAF3IP1-204ENST00000462122 922 ntTSL 311.32□□□□□ -0.66e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 PLEKHA7-210ENST00000530489 3688 ntTSL 1 (best)11.31□□□□□ -0.66e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 PIGG-225ENST00000514953 583 ntTSL 411.31□□□□□ -0.66e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 PLEKHA7-219ENST00000637162 3602 ntTSL 511.31□□□□□ -0.66e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ATF6B-212ENST00000468502 564 ntTSL 211.3□□□□□ -0.66e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 INPP5F-201ENST00000361976 5063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.67e-13■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TMEM14C-204ENST00000495549 479 ntTSL 211.24□□□□□ -0.616e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 MICAL3-202ENST00000383094 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.616e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 MICAL3-204ENST00000414725 4756 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.626e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 PLEKHA7-217ENST00000636090 3273 ntTSL 511.12□□□□□ -0.636e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 GIT1-212ENST00000581925 610 ntTSL 411.1□□□□□ -0.636e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 CNN2-211ENST00000606983 537 ntTSL 311.08□□□□□ -0.646e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 PGD-205ENST00000483936 680 ntTSL 511.02□□□□□ -0.652e-6■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ARPC4-206ENST00000479956 506 ntTSL 410.97□□□□□ -0.656e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 DPH1-216ENST00000576891 537 ntTSL 410.97□□□□□ -0.656e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 CDIP1-214ENST00000589890 476 ntTSL 510.92□□□□□ -0.666e-7■■■■■ 47.1
Retrieved 100 of 48,698 protein–RNA pairs in 1692.3 ms