Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERPUD1Q15011 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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