Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
SHPRHQ149N8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
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