Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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ODF1Q14990 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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