Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPRCAPQ14761 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms