Protein–RNA interactions for Protein: Q14088

RAB33A, Ras-related protein Rab-33A, humanhuman

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB33AQ14088 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB33AQ14088 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB33AQ14088 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB33AQ14088 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB33AQ14088 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB33AQ14088 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB33AQ14088 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB33AQ14088 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB33AQ14088 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB33AQ14088 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB33AQ14088 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB33AQ14088 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB33AQ14088 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB33AQ14088 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB33AQ14088 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB33AQ14088 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB33AQ14088 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB33AQ14088 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB33AQ14088 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB33AQ14088 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB33AQ14088 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB33AQ14088 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB33AQ14088 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB33AQ14088 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB33AQ14088 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB33AQ14088 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB33AQ14088 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB33AQ14088 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB33AQ14088 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB33AQ14088 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB33AQ14088 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB33AQ14088 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB33AQ14088 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB33AQ14088 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB33AQ14088 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB33AQ14088 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB33AQ14088 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB33AQ14088 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB33AQ14088 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB33AQ14088 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB33AQ14088 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
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