Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
CNGB1Q14028 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CNGB1Q14028 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CNGB1Q14028 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CNGB1Q14028 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
CNGB1Q14028 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CNGB1Q14028 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CNGB1Q14028 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CNGB1Q14028 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CNGB1Q14028 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CNGB1Q14028 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CNGB1Q14028 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CNGB1Q14028 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CNGB1Q14028 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CNGB1Q14028 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CNGB1Q14028 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CNGB1Q14028 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CNGB1Q14028 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CNGB1Q14028 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CNGB1Q14028 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CNGB1Q14028 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CNGB1Q14028 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CNGB1Q14028 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
CNGB1Q14028 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CNGB1Q14028 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CNGB1Q14028 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CNGB1Q14028 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CNGB1Q14028 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CNGB1Q14028 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CNGB1Q14028 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CNGB1Q14028 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CNGB1Q14028 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CNGB1Q14028 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.49
CNGB1Q14028 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CNGB1Q14028 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
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