Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1DQ13901 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1DQ13901 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1DQ13901 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
C1DQ13901 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1DQ13901 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1DQ13901 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1DQ13901 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1DQ13901 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1DQ13901 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1DQ13901 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1DQ13901 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1DQ13901 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1DQ13901 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1DQ13901 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1DQ13901 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1DQ13901 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1DQ13901 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1DQ13901 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1DQ13901 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1DQ13901 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1DQ13901 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1DQ13901 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1DQ13901 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1DQ13901 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1DQ13901 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1DQ13901 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1DQ13901 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1DQ13901 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
C1DQ13901 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1DQ13901 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1DQ13901 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1DQ13901 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1DQ13901 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1DQ13901 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1DQ13901 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1DQ13901 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1DQ13901 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1DQ13901 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1DQ13901 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1DQ13901 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1DQ13901 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1DQ13901 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1DQ13901 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1DQ13901 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1DQ13901 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1DQ13901 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1DQ13901 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1DQ13901 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
C1DQ13901 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
C1DQ13901 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
C1DQ13901 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1DQ13901 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1DQ13901 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1DQ13901 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1DQ13901 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1DQ13901 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1DQ13901 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1DQ13901 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1DQ13901 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1DQ13901 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1DQ13901 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1DQ13901 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1DQ13901 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1DQ13901 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1DQ13901 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
C1DQ13901 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1DQ13901 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1DQ13901 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1DQ13901 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1DQ13901 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1DQ13901 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C1DQ13901 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C1DQ13901 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
C1DQ13901 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1DQ13901 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1DQ13901 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1DQ13901 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1DQ13901 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1DQ13901 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1DQ13901 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1DQ13901 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1DQ13901 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1DQ13901 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1DQ13901 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1DQ13901 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1DQ13901 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1DQ13901 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1DQ13901 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1DQ13901 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1DQ13901 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1DQ13901 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1DQ13901 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1DQ13901 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1DQ13901 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1DQ13901 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1DQ13901 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C1DQ13901 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C1DQ13901 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C1DQ13901 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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