Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms