Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC33■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC33■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PKD2Q13563 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PKD2Q13563 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
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