Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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