Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MKRN4PQ13434 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
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