Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNTA1Q13424 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
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