Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms