Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCGB2A2Q13296 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCGB2A2Q13296 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCGB2A2Q13296 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCGB2A2Q13296 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCGB2A2Q13296 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCGB2A2Q13296 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCGB2A2Q13296 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCGB2A2Q13296 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCGB2A2Q13296 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCGB2A2Q13296 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCGB2A2Q13296 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCGB2A2Q13296 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCGB2A2Q13296 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCGB2A2Q13296 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCGB2A2Q13296 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCGB2A2Q13296 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCGB2A2Q13296 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCGB2A2Q13296 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SCGB2A2Q13296 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCGB2A2Q13296 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCGB2A2Q13296 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCGB2A2Q13296 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCGB2A2Q13296 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCGB2A2Q13296 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCGB2A2Q13296 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCGB2A2Q13296 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCGB2A2Q13296 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCGB2A2Q13296 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCGB2A2Q13296 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCGB2A2Q13296 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCGB2A2Q13296 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCGB2A2Q13296 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCGB2A2Q13296 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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SCGB2A2Q13296 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
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SCGB2A2Q13296 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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SCGB2A2Q13296 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCGB2A2Q13296 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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