Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
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