Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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BNIP3Q12983 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BNIP3Q12983 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNIP3Q12983 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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BNIP3Q12983 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNIP3Q12983 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNIP3Q12983 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNIP3Q12983 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BNIP3Q12983 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNIP3Q12983 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNIP3Q12983 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNIP3Q12983 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNIP3Q12983 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNIP3Q12983 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNIP3Q12983 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNIP3Q12983 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BNIP3Q12983 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BNIP3Q12983 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BNIP3Q12983 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BNIP3Q12983 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BNIP3Q12983 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BNIP3Q12983 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BNIP3Q12983 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BNIP3Q12983 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BNIP3Q12983 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BNIP3Q12983 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BNIP3Q12983 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BNIP3Q12983 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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