Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 ZFP30-206ENST00000587199 557 ntTSL 416.26■□□□□ 0.195e-8■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.035e-8■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 ZFP30-210ENST00000589676 598 ntTSL 315.06■□□□□ 05e-8■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.115e-8■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 SHANK2-209ENST00000445654 522 ntTSL 314.01□□□□□ -0.175e-8■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 IPO7-206ENST00000533233 578 ntTSL 413.46□□□□□ -0.256e-8■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.265e-8■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 ZNF781-204ENST00000593040 527 ntTSL 313.08□□□□□ -0.325e-8■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 IPO7-208ENST00000630083 195 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.456e-8■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.485e-8■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.515e-8■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 SHANK2-205ENST00000412252 1376 ntTSL 511.79□□□□□ -0.525e-8■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 SHANK2-201ENST00000338508 7271 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.555e-8■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 ZFP30-205ENST00000586732 673 ntTSL 311.14□□□□□ -0.635e-8■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 ZNF781-203ENST00000590008 2148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.735e-8■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 SHANK2-208ENST00000426687 460 ntTSL 58.67□□□□□ -1.025e-8■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 ZNF781-201ENST00000358582 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.155e-8■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.962e-7■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.142e-6■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.252e-6■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.282e-6■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 MED15-211ENST00000433831 3267 ntTSL 513.01□□□□□ -0.332e-6■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.462e-6■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.51e-6■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 SLMAP-203ENST00000383718 6749 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.881e-6■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.271e-6■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.491e-6■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.651e-6■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 TJP2-205ENST00000423935 614 ntTSL 218.76■□□□□ 0.598e-7■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 08e-7■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.428e-7■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 TJP2-210ENST00000606364 591 ntTSL 412.19□□□□□ -0.468e-7■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 TJP2-203ENST00000377259 588 ntTSL 39.77□□□□□ -0.858e-7■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 MICALL2-208ENST00000472100 5248 ntTSL 217.56■□□□□ 0.43e-7■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.013e-7■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 MICALL2-202ENST00000413446 3046 ntTSL 212.49□□□□□ -0.413e-7■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.154e-6■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 OSBPL3-210ENST00000415952 568 ntTSL 414.11□□□□□ -0.154e-6■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 FOXP1-207ENST00000471386 299 ntTSL 1 (best)25.39■■□□□ 1.664e-7■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 FOXP1-217ENST00000498154 535 ntTSL 324.35■■□□□ 1.494e-7■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.064e-9■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.414e-9■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.094e-9■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 TBL1XR1-201ENST00000352800 611 ntTSL 521.28■■□□□ 14e-7■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 TBL1XR1-204ENST00000422442 564 ntTSL 518.55■□□□□ 0.564e-7■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 TBL1XR1-203ENST00000422066 604 ntTSL 417.7■□□□□ 0.424e-7■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 TBL1XR1-209ENST00000431421 550 ntTSL 417.7■□□□□ 0.424e-7■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 TBL1XR1-219ENST00000627825 312 ntTSL 516.98■□□□□ 0.314e-7■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 TBL1XR1-217ENST00000626672 568 ntTSL 416.65■□□□□ 0.264e-7■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 TBL1XR1-206ENST00000427349 554 ntTSL 316.44■□□□□ 0.224e-7■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 TBL1XR1-202ENST00000413084 592 ntTSL 416.44■□□□□ 0.224e-7■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 TBL1XR1-210ENST00000431674 559 ntTSL 416■□□□□ 0.154e-7■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 TBL1XR1-213ENST00000450267 588 ntTSL 315.71■□□□□ 0.114e-7■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 TBL1XR1-214ENST00000457928 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.724e-7■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 TBL1XR1-207ENST00000428970 575 ntTSL 49.65□□□□□ -0.864e-7■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 TBL1XR1-231ENST00000637137 107 ntTSL 57.28□□□□□ -1.244e-7■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 TBL1XR1-211ENST00000437738 565 ntTSL 57.18□□□□□ -1.264e-7■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 TBL1XR1-205ENST00000424913 592 ntTSL 46.9□□□□□ -1.34e-7■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 TBL1XR1-220ENST00000630796 656 ntTSL 56.88□□□□□ -1.314e-7■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 TBL1XR1-224ENST00000635794 768 ntTSL 54.97□□□□□ -1.614e-7■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 TBL1XR1-212ENST00000443315 580 ntTSL 44.3□□□□□ -1.724e-7■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 TBL1XR1-221ENST00000630833 567 ntTSL 44.15□□□□□ -1.754e-7■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 TBL1XR1-216ENST00000491623 582 ntTSL 53.76□□□□□ -1.814e-7■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 TBL1XR1-232ENST00000637544 214 ntTSL 52.35□□□□□ -2.034e-7■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.14e-7■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 MSL2-203ENST00000473093 543 ntTSL 414.35□□□□□ -0.111e-6■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.21e-6■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.451e-6■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 MSL2-205ENST00000491050 559 ntTSL 44.72□□□□□ -1.651e-6■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 MSL2-204ENST00000481989 576 ntTSL 42.39□□□□□ -2.031e-6■■■■□ 23.7
ILF3Q12906 RSPRY1-205ENST00000562768 585 ntTSL 44.47□□□□□ -1.696e-7■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 RNF103-CHMP3-201ENST00000440757 805 ntTSL 318.72■□□□□ 0.595e-7■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 CHMP3-207ENST00000485465 920 ntTSL 317.24■□□□□ 0.355e-7■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.275e-7■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 CHMP3-202ENST00000393773 727 ntTSL 315.37■□□□□ 0.055e-7■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.275e-7■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 CHMP3-208ENST00000486404 650 ntTSL 312.86□□□□□ -0.355e-7■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 CHMP3-204ENST00000409727 1851 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.485e-7■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 CHMP3-201ENST00000263856 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.65e-7■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 MEMO1-209ENST00000490459 1242 ntTSL 214.24□□□□□ -0.135e-8■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 MEMO1-201ENST00000295065 4505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.515e-8■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 MEMO1-207ENST00000426310 1336 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.545e-8■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 MEMO1-203ENST00000404530 1482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.055e-8■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 DPY30-206ENST00000446765 1519 ntTSL 53.33□□□□□ -1.885e-8■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 NPIPB4-211ENST00000539318 695 ntTSL 58.79□□□□□ -13e-7■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 NPIPB4-207ENST00000536041 513 ntTSL 47.82□□□□□ -1.163e-7■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 NPIPB4-220ENST00000544693 400 ntTSL 46.03□□□□□ -1.443e-7■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 NPIPB4-214ENST00000541674 544 ntTSL 45.4□□□□□ -1.543e-7■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 CD74-206ENST00000518797 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 213.93□□□□□ -0.182e-7■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 CD74-203ENST00000377795 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.332e-7■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.362e-7■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 TPD52-217ENST00000521241 723 ntTSL 522.7■■□□□ 1.221e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.912e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 NAA20-207ENST00000484480 1222 ntTSL 520.76■□□□□ 0.912e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.882e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.852e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 SLC11A2-210ENST00000547510 924 ntTSL 520.28■□□□□ 0.842e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 TPD52-215ENST00000520795 445 ntTSL 220.09■□□□□ 0.811e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 SLC11A2-222ENST00000550714 587 ntTSL 419.4■□□□□ 0.72e-6■■■■□ 23.6
ILF3Q12906 TPD52-226ENST00000523753 587 ntTSL 419.39■□□□□ 0.691e-6■■■■□ 23.6
Retrieved 100 of 15,265 protein–RNA pairs in 128.5 ms