Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH17Q12864 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
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