Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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GTF3C1Q12789 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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GTF3C1Q12789 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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GTF3C1Q12789 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C1Q12789 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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GTF3C1Q12789 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C1Q12789 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C1Q12789 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C1Q12789 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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GTF3C1Q12789 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C1Q12789 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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GTF3C1Q12789 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
GTF3C1Q12789 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
GTF3C1Q12789 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
GTF3C1Q12789 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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