Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXO1Q12778 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXO1Q12778 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXO1Q12778 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXO1Q12778 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXO1Q12778 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXO1Q12778 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXO1Q12778 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXO1Q12778 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXO1Q12778 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXO1Q12778 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXO1Q12778 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXO1Q12778 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXO1Q12778 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXO1Q12778 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXO1Q12778 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXO1Q12778 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXO1Q12778 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXO1Q12778 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXO1Q12778 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXO1Q12778 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXO1Q12778 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXO1Q12778 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXO1Q12778 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXO1Q12778 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXO1Q12778 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXO1Q12778 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXO1Q12778 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXO1Q12778 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXO1Q12778 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXO1Q12778 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXO1Q12778 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXO1Q12778 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms