Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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