Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD300CQ08708 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CD300CQ08708 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD300CQ08708 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD300CQ08708 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD300CQ08708 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD300CQ08708 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD300CQ08708 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD300CQ08708 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD300CQ08708 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD300CQ08708 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD300CQ08708 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD300CQ08708 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CD300CQ08708 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD300CQ08708 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD300CQ08708 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD300CQ08708 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD300CQ08708 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD300CQ08708 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD300CQ08708 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD300CQ08708 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD300CQ08708 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD300CQ08708 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD300CQ08708 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.7 ms