Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDR1Q08345 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms